Bioinformatik und Bildverarbeitung
Diese TIMed CENTER Core Facility möchte die Basis für die Verwaltung und Integration biologischer Daten schaffen.
Darüber hinaus sollen auch verschiedene Analysen für diese speziellen Daten entwickelt werden. Um die Analysen biomedizinischer oder molekularbiologischer Daten zu automatisieren, werden am FH OÖ-Campus Hagenberg Algorithmen und intelligente Softwaresysteme programmiert. Diese unterstützen LebenswissenschaftlerInnen wie ÄrztInnen, BiologInnen und GenetikerInnen bei ihrer täglichen Arbeit.
Mithilfe der Bioinformatik lassen sich auch biologische Prozesse simulieren. Die Forschungs- und Entwicklungsprojekte, an welchen seit Jahren gearbeitet wird, werden zusammen mit PartnerInnen aus Wissenschaft und Wirtschaft durchgeführt. Aus diesen fruchtbaren Kooperationen gingen bereits einige nützliche Algorithmen und Methoden hervor, darunter zum Beispiel Sequenzanalyse-Programme und Analyse-Algorithmen für die Identifikation von Proteinen.
Funktionen
- Automatisierte Bearbeitung und Analyse von Mikroskopie-Aufnahmen
- Identifikation von Zusammenhängen in biologischen und medizinischen Daten durch angewandte Statistik und maschinelles Lernen
- Identifikation von Peptiden und Proteinen aus Massenspektren
- Analyse von NGS Daten
Services
- Spotty, ein Framework für die Analyse von Mikroskopie-Aufnahmen
- MS Amanda, ein Algorithmus zur Identifikation von Peptiden und Proteinen
- IMEX, ein Framework für die Analyse von NGS-Daten