Neue Publikation Proteomik 2024

Die Forschungsgruppe Bioinformatik an der FH OÖ in Hagenberg beschreibt in einer neuen wissenschaftlichen Arbeit die Software "MS Annika 3.0", eine Crosslink-Suchmaschine - in Communications Chemistry. Die Crosslink-Massenspektrometrie ermöglicht die strukturelle Analyse von Proteinen und Proteinkomplexen und dient als leistungsfähiges Werkzeug bei Protein-Protein-Interaktionsstudien. Die Datenanalyse von großen, nicht spaltbarenCrosslink-Studien bleibt jedoch eine Herausforderung. In dieser Publikation stellen wir MS Annika 3.0 vor, einen Algorithmus für die proteomweite Identifizierung von nicht spaltbaren Querverbindungen, der sich durch hohe Empfindlichkeit, genaue FDR-Schätzung und Rechenleistung auszeichnet und die Struktur des C. elegans Box C/D-Komplexes aufdeckt. Gratulation zu dieser Arbeit!